Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6CQ53S08 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB6CQ53S08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms