Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP55Q53EZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP55Q53EZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP55Q53EZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms