Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VWA3BQ502W6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VWA3BQ502W6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms