Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUS10Q3MIT2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUS10Q3MIT2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS10Q3MIT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms