Protein–RNA interactions for Protein: Q3LXA3

TKFC, Triokinase/FMN cyclase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TKFCQ3LXA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TKFCQ3LXA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TKFCQ3LXA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms