Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRFIP1Q32MZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRFIP1Q32MZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRFIP1Q32MZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms