Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-BQ31612 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-BQ31612 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms