Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTU2Q2VPK5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTU2Q2VPK5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTU2Q2VPK5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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