Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VMACQ2NL98 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms