Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C17orf58Q2M2W7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C17orf58Q2M2W7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms