Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GEN1Q17RS7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEN1Q17RS7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEN1Q17RS7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms