Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA3Q16787 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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