Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYPL1Q16563 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms