Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLFQ16534 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLFQ16534 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLFQ16534 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLFQ16534 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HLFQ16534 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLFQ16534 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HLFQ16534 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLFQ16534 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLFQ16534 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLFQ16534 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLFQ16534 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLFQ16534 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLFQ16534 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HLFQ16534 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLFQ16534 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLFQ16534 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLFQ16534 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLFQ16534 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HLFQ16534 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLFQ16534 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HLFQ16534 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HLFQ16534 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HLFQ16534 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HLFQ16534 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HLFQ16534 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLFQ16534 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HLFQ16534 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLFQ16534 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLFQ16534 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLFQ16534 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLFQ16534 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLFQ16534 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLFQ16534 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLFQ16534 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HLFQ16534 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLFQ16534 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLFQ16534 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLFQ16534 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLFQ16534 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLFQ16534 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLFQ16534 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLFQ16534 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HLFQ16534 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HLFQ16534 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLFQ16534 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLFQ16534 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLFQ16534 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HLFQ16534 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms