Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSX1Q16384 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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SSX1Q16384 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SSX1Q16384 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SSX1Q16384 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX1Q16384 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX1Q16384 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
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