Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMA4Q16363 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LAMA4Q16363 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMA4Q16363 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
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