Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAMP3Q15836 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP3Q15836 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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