Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIP13Q15645 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms