Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTF1Q15361 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF1Q15361 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF1Q15361 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms