Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCM1Q15154 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCM1Q15154 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms