Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX17Q15036 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNX17Q15036 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX17Q15036 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
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