Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD6Q15008 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMD6Q15008 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMD6Q15008 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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