Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCAPHQ15003 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCAPHQ15003 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCAPHQ15003 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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