Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-9■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 C1QBP-203ENST00000573204 911 ntTSL 29.83□□□□□ -0.841e-12■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 C1QBP-205ENST00000573421 330 ntTSL 22.89□□□□□ -1.951e-12■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 ATG3-209ENST00000496423 737 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.842e-31■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.322e-31■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-11■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.436e-16■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.616e-16■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 WAC-217ENST00000526722 585 ntTSL 414.48□□□□□ -0.092e-15■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 WAC-220ENST00000532233 543 ntTSL 414.3□□□□□ -0.122e-15■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 WAC-218ENST00000528491 507 ntTSL 414.3□□□□□ -0.122e-15■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 PPP1R12A-210ENST00000548908 3066 ntTSL 57.74□□□□□ -1.173e-12■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 PPP1R12A-214ENST00000550299 683 ntTSL 56□□□□□ -1.453e-12■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SRRT-207ENST00000466432 378 ntTSL 214.18□□□□□ -0.141e-9■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.474e-10■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.184e-10■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.171e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.121e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.141e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.641e-13■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.28e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-10■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 316.2■□□□□ 0.189e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-208ENST00000566515 1634 ntTSL 520.77■□□□□ 0.929e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-208ENST00000531189 577 ntTSL 220.43■□□□□ 0.869e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.859e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-205ENST00000564630 2079 ntTSL 519.2■□□□□ 0.669e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-209ENST00000531418 585 ntTSL 318.79■□□□□ 0.69e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-207ENST00000529437 602 ntTSL 218.35■□□□□ 0.539e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-211ENST00000567434 713 ntTSL 317.84■□□□□ 0.459e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-204ENST00000563065 1450 ntTSL 217.29■□□□□ 0.369e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.349e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-215ENST00000569745 1356 ntTSL 517.02■□□□□ 0.319e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 416.61■□□□□ 0.259e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 216.14■□□□□ 0.179e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-213ENST00000568507 1385 ntTSL 215.9■□□□□ 0.149e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-203ENST00000562553 736 ntTSL 215.88■□□□□ 0.139e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.49■□□□□ 0.079e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.58□□□□□ -0.089e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.189e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-206ENST00000565296 1831 ntTSL 213.55□□□□□ -0.249e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.42□□□□□ -0.429e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.479e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-214ENST00000568936 2088 ntTSL 210.83□□□□□ -0.689e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-210ENST00000566882 2746 ntTSL 29.62□□□□□ -0.879e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.5□□□□□ -0.899e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-202ENST00000444658 1479 ntTSL 28.61□□□□□ -1.039e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 CCNDBP1-212ENST00000567690 936 ntTSL 57.63□□□□□ -1.199e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SERPINH1-213ENST00000532356 998 ntTSL 319.06■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SERPINH1-207ENST00000526397 882 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 SERPINH1-204ENST00000525611 974 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-31■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-31■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 NAP1L1-208ENST00000547529 892 ntTSL 55.96□□□□□ -1.462e-31■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)21.31■■□□□ 15e-7■■■□□ 15.7
PUM1Q14671 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 219.66■□□□□ 0.745e-19■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 218.78■□□□□ 0.65e-19■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.115e-19■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 210.88□□□□□ -0.672e-7■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 28.08□□□□□ -1.122e-7■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TCOF1-204ENST00000427724 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.98□□□□□ -0.816e-7■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 334.38■■■■□ 3.091e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 CDC34-203ENST00000586788 900 ntTSL 225.82■■□□□ 1.721e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 323.91■■□□□ 1.421e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.361e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 323.09■■□□□ 1.291e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 521.82■■□□□ 1.081e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 221.47■■□□□ 1.031e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.991e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 320.65■□□□□ 0.91e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.881e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 320.3■□□□□ 0.841e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.771e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.651e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 318.2■□□□□ 0.51e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 PHRF1-204ENST00000532550 748 ntTSL 317.98■□□□□ 0.471e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NHP2-205ENST00000511078 475 ntTSL 217.42■□□□□ 0.381e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 516.78■□□□□ 0.281e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NHP2-206ENST00000514354 472 ntTSL 316.02■□□□□ 0.161e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.031e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 314.52□□□□□ -0.091e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 514.22□□□□□ -0.131e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 NHP2-203ENST00000502263 552 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-9■■■□□ 15.6
PUM1Q14671 RBM19-206ENST00000552386 692 ntTSL 28.87□□□□□ -0.991e-9■■■□□ 15.6
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 86.4 ms