Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF235Q14590 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF235Q14590 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF235Q14590 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms