Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCINQ13939 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCINQ13939 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCINQ13939 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCINQ13939 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCINQ13939 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCINQ13939 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCINQ13939 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCINQ13939 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCINQ13939 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCINQ13939 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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