Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF2H2Q13888 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H2Q13888 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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