Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOFQ13790 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOFQ13790 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOFQ13790 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOFQ13790 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOFQ13790 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOFQ13790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOFQ13790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOFQ13790 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOFQ13790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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