Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL3Q13618 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CUL3Q13618 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CUL3Q13618 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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