Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KRR1Q13601 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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