Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB3Q13509 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB3Q13509 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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