Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC3Q13507 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC3Q13507 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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