Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXE3Q13461 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXE3Q13461 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms