Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB3BPQ13352 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB3BPQ13352 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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