Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERCC8Q13216 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERCC8Q13216 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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