Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1H3Q13133 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1H3Q13133 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1H3Q13133 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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