Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK3Q13003 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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