Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRMPQ12912 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRMPQ12912 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms