Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX4Q12846 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX4Q12846 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX4Q12846 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX4Q12846 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX4Q12846 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX4Q12846 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX4Q12846 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX4Q12846 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX4Q12846 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX4Q12846 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX4Q12846 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX4Q12846 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX4Q12846 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX4Q12846 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX4Q12846 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STX4Q12846 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
STX4Q12846 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
STX4Q12846 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STX4Q12846 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STX4Q12846 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STX4Q12846 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STX4Q12846 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STX4Q12846 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STX4Q12846 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STX4Q12846 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STX4Q12846 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STX4Q12846 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STX4Q12846 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms