Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TROAPQ12815 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TROAPQ12815 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms