Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFEMP1Q12805 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFEMP1Q12805 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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