Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 APC4YDR118W 1959 nt4.14□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 TUB3YML124C 1338 nt4.14□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 ISR1YPR106W 1332 nt4.14□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MBP1YDL056W 2502 nt4.14□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 SER33YIL074C 1410 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 NUP2YLR335W 2163 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 CBP1YJL209W 1965 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 RPL34AYER056C-A 366 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YNG2YHR090C 849 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 FBP1YLR377C 1047 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 CSR1YLR380W 1227 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MAC1YMR021C 1254 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YOR200WYOR200W 399 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 RAD16YBR114W 2373 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 SIS2YKR072C 1689 nt4.13□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 AIM10YER087W 1731 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 IMA3YIL172C 1770 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 IMA4YJL221C 1770 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 FPK1YNR047W 2682 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MMS21YEL019C 804 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 BUD17YNR027W 954 nt4.12□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 ARH1YDR376W 1482 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MET3YJR010W 1536 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 GPR1YDL035C 2886 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 RAM1YDL090C 1296 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 DON1YDR273W 1098 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YGR122WYGR122W 1209 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 VHS2YIL135C 1311 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 KCC4YCL024W 3114 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 LPL1YOR059C 1353 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MMR1YLR190W 1476 nt4.11□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 GIP2YER054C 1647 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 SPC42YKL042W 1092 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YLR346CYLR346C 306 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 PRE7YBL041W 726 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 TOM40YMR203W 1164 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 COT1YOR316C 1320 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MET4YNL103W 2019 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MCM4YPR019W 2802 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 MUM3YOR298W 1440 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 VBA2YBR293W 1425 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 PCL8YPL219W 1479 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 UBP7YIL156W 3216 nt4.1□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 NAT2YGR147C 867 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 SPO12YHR152W 522 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 ECM1YAL059W 639 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 GTR1YML121W 933 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YOR292CYOR292C 930 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 YPL113CYPL113C 1191 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 TGS1YPL157W 948 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 POP4YBR257W 840 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 WTM1YOR230W 1314 nt4.09□□□□□ -1.75
TIR4Q12218 STP4YDL048C 1473 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 UBC6YER100W 753 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 SWC3YAL011W 1878 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 CAB3YKL088W 1716 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 HOT1YMR172W 2160 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 BUD7YOR299W 2241 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.08□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 XKS1YGR194C 1803 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 YJR015WYJR015W 1533 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 YDR132CYDR132C 1488 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 UPC2YDR213W 2742 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 ARG82YDR173C 1068 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 TFB3YDR460W 966 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 SNA2YDR525W-A 240 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 YHL049CYHL049C 816 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 ISY1YJR050W 708 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 NUP116YMR047C 3342 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 ARN1YHL040C 1884 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 HOYDL227C 1761 nt4.07□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 IMD2YHR216W 1572 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 STR2YJR130C 1920 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 PCL6YER059W 1263 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 LYS5YGL154C 819 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 MRPL25YGR076C 474 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 SMA1YPL027W 738 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 HRK1YOR267C 2280 nt4.06□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 PMC1YGL006W 3522 nt4.05□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 VAC7YNL054W 3498 nt4.05□□□□□ -1.76
TIR4Q12218 SLD2YKL108W 1362 nt4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms