Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD3Q0VAK6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms