Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC15Q0P6D6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC15Q0P6D6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms