Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIPPLY1Q0D2K3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms