Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2AQ08AH3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2AQ08AH3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2AQ08AH3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms