Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms