Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUDPQ08623 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms