Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms