Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHX9Q08211 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms